距离假面骑士圣刃与各位剑士携手战斗保护世界，已经过去了8年。世界一派祥和宁静，众人都找到了自己的归宿与梦想。主人公神山飞羽真收养了8年前突然出现在书店门口的孩子——小陆；伦太郎与芽依打打闹闹，关系亲密；贤人有了一份翻译的工作，并和女朋友结菜谈婚论嫁中。但最近怪事频发，不断有剑士消失，身边人也想不起来他们的身影，这一切都和无铭剑虚无有关。原来是剑士们曾经的战斗波及了许多无辜的人，所以伦太郎的父亲篠崎真二郎、贤人的未婚妻结菜、飞羽真的好友间宫陆，决定复仇，让剑士消失。他们篡改了人们的记忆，渐渐抹去剑士的痕迹。