水师一直是朝廷牢牢掌握着的，包括目前三大水师的登莱、福建、广东水师，除了登莱外，福建和广东水师也主要是当地人，但是上船当兵的都是穷苦人家，和士绅们并无瓜葛，而武将武官们也多是从这些士卒中擢拔而来，与海商来往相对密切。