凌雨菲和运河精灵们在一次次守护运河历史的故事中，终于唤醒了被淤泥污染的沙灵。这一天，雨菲和包括沙灵在内的运河精灵们游览大运河森林公园，在游览过程中，大家赞叹通州运河公园建设的鬼斧神工。沙灵突然感觉到什么，钻入水下，和运河精灵一道，赶出了潜伏在水下的黑沙。经过一场苦战，黑沙不知所踪。玉象爷爷却告诉大家，那是之前一直附着在沙灵身上的淤泥，沾染了沙灵身上的灵气，变成了现在的新黑沙。黑沙回到历史中去破坏运河，只是这次他灵气并不充沛，走不远，大概就在通州附近了。为了阻止黑沙，雨菲和运河精灵们再次回到历史中，追踪黑沙故事讲述在和平美丽的行星AQUAFALL上，突然降落的陨石群放出了邪恶的东西，因此大地上的全部生物面临着要被消灭的危机，此时在AQUAFALL长大的龙族少女利维坦、巴哈姆特、约尔曼冈德、妖精塞罗普相遇了，并凭着各自共有的理念而一起迎击迫近而来的威胁。